ACM通信
ACM TechNews
杜克软件显著加快酶设计
杜克大学的研究人员开发了一种软件，向实验人员展示了如何改变细菌制造天然抗生素的机制。杜克大学教授布鲁斯·唐纳德说，该程序是一组被称为算法K*的计算机规则，它可以对一种关键酶的所有可能形状和变化进行排序，这种酶会产生一种名为gramicidin S的天然抗生素。新的软件可以更自动化地重新设计旧药物，以对抗耐药细菌。“这实质上是制造新型抗生素的新途径，”唐纳德说。“你可以对蛋白质进行许多可能的改变，但该算法可以测试出比单独实验室实验多出数量级的变化。”他说，该算法将使研究人员能够快速发现结果，否则通过实验技术需要更长的时间。唐纳德说:“原则上，只要把蛋白质的形状输入算法，告诉它你想让它做什么，就可以重新设计任何酶。”该算法包括一个“终端消除”功能，可以分析所有可能的化学相互作用和灵活的分子结构，以消除无法工作的场景。K*算法作为开放源代码可供研究人员评估和使用。
杜克大学查看全文
没有发现记录