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普林斯顿大学的研究人员收听了人类微生物组的化学对话


艺术家对人体微生物群的印象。

普林斯顿大学的研究人员开发了一种算法,可以通过分析和解释宏基因组测序数据来检测生物合成基因簇。

图源:Kateryna Kon/科学图片库/盖蒂图片社

普林斯顿大学的研究人员开发了一种计算机算法,可以通过分析和解释宏基因组测序数据来检测生物合成基因簇(BGCs),这些数据由从数百名人类受试者的组织或排泄物中收集的基因序列组成。

研究小组首先确定了合成特定分子或感兴趣的化学物质所必需的基因,然后使用计算算法对类似基因序列的宏基因组数据进行排序,将这些序列片段分组在一起。

然后,研究人员评估了每个群体在人群中的患病率,并使用分组序列来组装全长bgc。

他们通过研究是否能检测到参与II型多酮合成的BGCs来验证这种方法(该团队发现了13个这样的基因簇)。

普林斯顿大学
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版权所有©2019SmithBucklin美国华盛顿特区


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