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计算工具可靠地从单细胞rna测序数据区分癌症、正常细胞
德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员开发了一种计算技术，可以精确区分肿瘤样本中癌细胞和各种正常细胞的数据。
信贷:Vitanovski / iStock
德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员开发了一种计算工具，可以可靠地区分肿瘤样本中的癌变细胞和正常细胞。
科学家可以使用CopyKAT(非整倍体肿瘤的拷贝数核型分析)工具更容易地分析大型单细胞rna测序实验中的基因表达数据。
MD Anderson的Nicholas Navin指出，CopyKAT通过挖掘数据来发现大多数癌症典型的异常染色体数量，并在癌细胞中识别出不同的亚群或克隆。
Navin说:“通过将该工具应用于多个数据集，我们表明，在混合肿瘤样本中，我们可以明确地识别肿瘤细胞与其他免疫细胞或基质细胞，准确率约为99%。”
前MD Anderson研究员Ruli Gao补充说:“我们希望这个工具将有助于研究团体充分利用他们的单细胞rna测序数据，并推动癌症的新发现。”
从德克萨斯大学安德森癌症中心
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