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开拓模拟专注于HIV-1病毒


使用超级计算机资源开发了United Atom Disture(Martini Force-Field)的逼真HIV-1脂质囊泡的全规模模型。

关键发现表明,HIV-1病毒的复合物,不对称膜组成可以导致宏观性质,例如小叶和脂质微陶器形成之间的差分位移。

信用:布莱格等人。

研究人员使用超级计算机生成了HIV-1病毒脂质体和基因组衣壳的第一个生物学真实的计算机模拟。

特拉华大学亚历克斯布莱格及同事们雇用了德克萨斯高级计算中心(TACC)的Stampede2和Frontera系统;匹兹堡超级计算中心的桥梁-2超级计算机;在美国能源部洛杉矶国家实验室和全国超级计算申请中心的蓝色水域北美。

“我能够执行计算,而无需转移数据,我可以通过Tacc门户网站设置可视化会话,并在Stampede2上直接与我的数据进行分析,并与我的数据进行分析,”Bryer说。

他还强调了在Frontera上进行的分析,这些分析在几分钟的数据中处理,可能已经在三周内进行串行幼稚实施。

该项目的重点是HIV-1病毒包络在感染期间的反应。

德克萨斯高级计算中心
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摘要版权所有©2022史密斯巴克林,华盛顿,直流,美国


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